| Ident. | Authors (with country if any) | Title |
|---|
| 000373 (2020) |
Maria L. Irigoyen [États-Unis] ; Danielle C. Garceau [États-Unis] ; Adriana Bohorquez-Chaux [Colombie] ; Luis Augusto Becerra Lopez-Lavalle [Colombie] ; Laura Perez-Fons [Royaume-Uni] ; Paul D. Fraser [Royaume-Uni] ; Linda L. Walling [États-Unis] | Genome-wide analyses of cassava Pathogenesis-related (PR) gene families reveal core transcriptome responses to whitefly infestation, salicylic acid and jasmonic acid. |
| 000403 (2020) |
Małgorzata Jakubowicz [Pologne] ; Witold Nowak [Pologne] ; Łukasz Gałga Ski [Pologne] ; Danuta Babula-Skowro Ska [Pologne] ; Piotr Kubiak [Pologne] | Expression profiling of the genes encoding ABA route components and the ACC oxidase isozymes in the senescing leaves of Populus tremula. |
| 000635 (2019) |
Min-Ha Kim [Corée du Sud] ; Jin-Seong Cho [Corée du Sud] ; Hyung-Woo Jeon [Corée du Sud, Australie] ; Kanidta Sangsawang [Corée du Sud] ; Donghwan Shim [Corée du Sud] ; Young-Im Choi [Corée du Sud] ; Eung-Jun Park [Corée du Sud] ; Hyoshin Lee [Corée du Sud] ; Jae-Heung Ko [Corée du Sud] | Wood Transcriptome Profiling Identifies Critical Pathway Genes of Secondary Wall Biosynthesis and Novel Regulators for Vascular Cambium Development in Populus. |
| 000639 (2019) |
Qari Muhammad Imran [Corée du Sud] ; Sang-Uk Lee [Corée du Sud] ; Bong-Gyu Mun [Corée du Sud] ; Adil Hussain [Pakistan] ; Sajjad Asaf [Oman] ; In-Jung Lee [Corée du Sud] ; Byung-Wook Yun [Corée du Sud] | WRKYs, the Jack-of-various-Trades, Modulate Dehydration Stress in Populus davidiana-A Transcriptomic Approach. |
| 000640 (2019) |
Yongzhi Yang [République populaire de Chine] ; Ying Li [République populaire de Chine] ; Qiao Chen [République populaire de Chine] ; Yongshuai Sun [République populaire de Chine] ; Zhiqiang Lu [République populaire de Chine] | WGDdetector: a pipeline for detecting whole genome duplication events using the genome or transcriptome annotations. |
| 000653 (2019) |
Hai Bao [République populaire de Chine] ; Min Chen [République populaire de Chine] ; Hui Chen [République populaire de Chine] ; Liang Du [République populaire de Chine] ; Yanwei Wang [République populaire de Chine] | Transcriptome-wide identification of miRNA targets and a TAS3-homologous gene in Populus by degradome sequencing. |
| 000654 (2019) |
Hai Bao [République populaire de Chine] ; Hui Chen [République populaire de Chine] ; Min Chen [République populaire de Chine] ; Huimin Xu [République populaire de Chine] ; Xiaowei Huo [République populaire de Chine] ; Qianhui Xu [République populaire de Chine] ; Yanwei Wang [République populaire de Chine] | Transcriptome-wide identification and characterization of microRNAs responsive to phosphate starvation in Populus tomentosa. |
| 000655 (2019) |
Jinnan Wang [République populaire de Chine] ; Yanting Tian [République populaire de Chine] ; Jihong Li [République populaire de Chine] ; Keqiang Yang [République populaire de Chine] ; Shiyan Xing [République populaire de Chine] ; Xiaojiao Han [République populaire de Chine] ; Dong Xu [République populaire de Chine] ; Yiwei Wang [République populaire de Chine] | Transcriptome sequencing of active buds from Populus deltoides CL. and Populus × zhaiguanheibaiyang reveals phytohormones involved in branching. |
| 000656 (2019) |
Kun Ning [République populaire de Chine] ; Changjun Ding [République populaire de Chine] ; Qinjun Huang [République populaire de Chine] ; Weixi Zhang [République populaire de Chine] ; Chengchao Yang [République populaire de Chine] ; Dejun Liang [République populaire de Chine] ; Ruting Fan [République populaire de Chine] ; Xiaohua Su [République populaire de Chine] | Transcriptome profiling revealed diverse gene expression patterns in poplar (Populus × euramericana) under different planting densities. |
| 000743 (2019) |
Niels A. Müller [Allemagne] ; Birgit Kersten [Allemagne] ; Matthias Fladung [Allemagne] ; Hilke Schroeder [Allemagne] | RNA-seq of eight different poplar clones reveals conserved up-regulation of gene expression in response to insect herbivory. |
| 000748 (2019) |
Yongyao Fu [République populaire de Chine] ; Papa Win [République populaire de Chine] ; Huijuan Zhang [République populaire de Chine] ; Chaofeng Li [République populaire de Chine] ; Yun Shen [République populaire de Chine] ; Fu He [République populaire de Chine] ; Keming Luo [République populaire de Chine] | PtrARF2.1 Is Involved in Regulation of Leaf Development and Lignin Biosynthesis in Poplar Trees. |
| 000788 (2019) |
Man Zhang [États-Unis, République populaire de Chine] ; Haktan Suren [États-Unis] ; Jason A. Holliday [États-Unis] | Phenotypic and Genomic Local Adaptation across Latitude and Altitude in Populus trichocarpa. |
| 000836 (2019) |
Nivi Abraham [États-Unis] ; Periasamy Chitrampalam [États-Unis] ; Berlin Nelson [États-Unis] ; Roshan Sharma Poudel [États-Unis] ; Kishore Chittem [États-Unis] ; Pawel Borowicz [États-Unis] ; Robert Brueggeman [États-Unis] ; Shalu Jain [États-Unis] ; Jared Michael Leboldus [États-Unis] | Microscopic, Biochemical, and Molecular Comparisons of Moderately Resistant and Susceptible Populus Genotypes Inoculated with Sphaerulina musiva. |
| 000923 (2019) |
Wan-Long Su [République populaire de Chine] ; Na Liu [République populaire de Chine] ; Li Mei [République populaire de Chine] ; Jie Luo [République populaire de Chine] ; Yi-Jie Zhu [République populaire de Chine] ; Zhu Liang [République populaire de Chine] | Global Transcriptomic Profile Analysis of Genes Involved in Lignin Biosynthesis and Accumulation Induced by Boron Deficiency in Poplar Roots. |
| 000929 (2019) |
Jin-Gui Liu [République populaire de Chine] ; Xiao Han [République populaire de Chine] ; Tong Yang [République populaire de Chine] ; Wen-Hui Cui [République populaire de Chine] ; Ai-Min Wu [République populaire de Chine] ; Chun-Xiang Fu [République populaire de Chine] ; Bai-Chen Wang [République populaire de Chine] ; Li-Jun Liu [République populaire de Chine] | Genome-wide transcriptional adaptation to salt stress in Populus. |
| 000939 (2019) |
Haifeng Yan [République populaire de Chine] ; Mingzhi Li [République populaire de Chine] ; Yuping Xiong [République populaire de Chine] ; Jianming Wu [République populaire de Chine] ; Jaime A. Teixeira Da Silva [Japon] ; Guohua Ma [République populaire de Chine] | Genome-Wide Characterization, Expression Profile Analysis of WRKY Family Genes in Santalum album and Functional Identification of Their Role in Abiotic Stress. |
| 000943 (2019) |
Mingyang Quan [République populaire de Chine] ; Qingzhang Du [République populaire de Chine] ; Liang Xiao [République populaire de Chine] ; Wenjie Lu [République populaire de Chine] ; Longxin Wang [République populaire de Chine] ; Jianbo Xie [République populaire de Chine] ; Yuepeng Song [République populaire de Chine] ; Baohua Xu [République populaire de Chine] ; Deqiang Zhang [République populaire de Chine] | Genetic architecture underlying the lignin biosynthesis pathway involves noncoding RNAs and transcription factors for growth and wood properties in Populus. |
| 000968 (2019) |
Y. Osako [Japon] ; N. Takata [Japon] ; Nuoendagula [Japon] ; S. Ishikawa [Japon] ; T. Umezawa [Japon] ; T. Taniguchi [Japon] ; S. Kajita [Japon] | Expression analysis of cellulose synthases that comprise the Type II complex in hybrid aspen. |
| 000A61 (2019) |
Yan Zhang [République populaire de Chine] ; Zheng'Ang Xiao [République populaire de Chine] ; Chang Zhan [République populaire de Chine] ; Meifeng Liu [République populaire de Chine] ; Wenxiu Xia [République populaire de Chine] ; Nian Wang [République populaire de Chine] | Comprehensive analysis of dynamic gene expression and investigation of the roles of hydrogen peroxide during adventitious rooting in poplar. |
| 000A62 (2019) |
Muhammad Shahid [Corée du Sud] ; Qari Muhammad Imran [Corée du Sud] ; Adil Hussain [Pakistan] ; Murtaza Khan [Corée du Sud] ; Sang Uk Lee [Corée du Sud] ; Bong Gyu Mun [Corée du Sud] ; Byung-Wook Yun [Corée du Sud] | Comprehensive Analyses of Nitric Oxide-Induced Plant Stem Cell-Related Genes in Arabidopsis thaliana. |
| 000A72 (2019) |
Shida Ji [République populaire de Chine] ; Zhihua Liu [République populaire de Chine] ; Bin Liu [République populaire de Chine] ; Yucheng Wang [République populaire de Chine] | Comparative analysis of biocontrol agent Trichoderma asperellum ACCC30536 transcriptome during its interaction with Populus davidiana × P. alba var. pyramidalis. |
| 000B74 (2019) |
Jianbo Li [République populaire de Chine] ; Pei Sun [République populaire de Chine] ; Yongxiu Xia [République populaire de Chine] ; Guangshun Zheng [République populaire de Chine] ; Jingshuang Sun [République populaire de Chine] ; Huixia Jia [République populaire de Chine] | A Stress-Associated Protein, PtSAP13, From Populus trichocarpa Provides Tolerance to Salt Stress. |
| 000C20 (2018) |
Chunxia Zhang [République populaire de Chine] ; Sen Meng [République populaire de Chine] ; Mingjun Li [République populaire de Chine] ; Zhong Zhao [République populaire de Chine] | Transcriptomic insight into nitrogen uptake and metabolism of Populus simonii in response to drought and low nitrogen stresses. |
| 000C93 (2018) |
Jing Ji [République populaire de Chine] ; Jianyun Yue [République populaire de Chine] ; Tiantian Xie [République populaire de Chine] ; Wei Chen [République populaire de Chine] ; Changjian Du [République populaire de Chine] ; Ermei Chang [République populaire de Chine] ; Lanzhen Chen [République populaire de Chine] ; Zeping Jiang [République populaire de Chine] ; Shengqing Shi [République populaire de Chine] | Roles of γ-aminobutyric acid on salinity-responsive genes at transcriptomic level in poplar: involving in abscisic acid and ethylene-signalling pathways. |
| 000D03 (2018) |
Meghan K. Rains [Canada] ; Nayana Dilini Gardiyehewa De Silva [Canada] ; Isabel Molina [Canada] | Reconstructing the suberin pathway in poplar by chemical and transcriptomic analysis of bark tissues. |
| 000D23 (2018) |
Stefania Giacomello [Suède] ; Joakim Lundeberg [Suède] | Preparation of plant tissue to enable Spatial Transcriptomics profiling using barcoded microarrays. |
| 000D73 (2018) |
Moritz Kaling [Allemagne] ; Anna Schmidt [Allemagne] ; Franco Moritz [Allemagne] ; Maaria Rosenkranz [Allemagne] ; Michael Witting [Allemagne] ; Karl Kasper [Allemagne] ; Dennis Janz [Allemagne] ; Philippe Schmitt-Kopplin [Allemagne] ; Jörg-Peter Schnitzler [Allemagne] ; Andrea Polle [Allemagne] | Mycorrhiza-Triggered Transcriptomic and Metabolomic Networks Impinge on Herbivore Fitness. |
| 000E34 (2018) |
H Earl Petzold [États-Unis] ; Stephen B. Rigoulot [États-Unis] ; Chengsong Zhao [États-Unis] ; Bidisha Chanda [États-Unis] ; Xiaoyan Sheng [États-Unis] ; Mingzhe Zhao [États-Unis, République populaire de Chine] ; Xiaoyan Jia [États-Unis] ; Allan W. Dickerman [États-Unis] ; Eric P. Beers [États-Unis] ; Amy M. Brunner [États-Unis] | Identification of new protein-protein and protein-DNA interactions linked with wood formation in Populus trichocarpa. |
| 000E38 (2018) |
Yinliang Wang [République populaire de Chine] ; Jian Zhang [République populaire de Chine] ; Qi Chen [République populaire de Chine] ; Hanbo Zhao [République populaire de Chine] ; Jiatong Wang [République populaire de Chine] ; Ming Wen [République populaire de Chine] ; Jinghui Xi [République populaire de Chine] ; Bingzhong Ren [République populaire de Chine] | Identification and evolution of olfactory genes in the small poplar longhorn beetle Saperda populnea. |
| 000E83 (2018) |
Phi-Yen Le [Corée du Sud] ; Hyung-Woo Jeon [Corée du Sud] ; Min-Ha Kim [Corée du Sud] ; Eung-Jun Park [Corée du Sud] ; Hyoshin Lee [Corée du Sud] ; Indeok Hwang [États-Unis] ; Kyung-Hwan Han [États-Unis] ; Jae-Heung Ko [Corée du Sud] | Gain-of-function mutation of AtDICE1, encoding a putative endoplasmic reticulum-localized membrane protein, causes defects in anisotropic cell elongation by disturbing cell wall integrity in Arabidopsis. |
| 000F46 (2018) |
E. Jurak [Finlande, Pays-Bas] ; H. Suzuki [Canada] ; G. Van Erven [Pays-Bas] ; J A Gandier [Canada] ; P. Wong [Canada] ; K. Chan [Canada] ; C Y Ho [Canada] ; Y. Gong [Canada] ; E. Tillier [Canada] ; M-N Rosso [France] ; M A Kabel [Pays-Bas] ; S. Miyauchi [France] ; E R Master [Finlande, Canada] | Dynamics of the Phanerochaete carnosa transcriptome during growth on aspen and spruce. |
| 001002 (2018) |
Jin Zhang [République populaire de Chine, États-Unis] ; Yu Li [République populaire de Chine] ; Bobin Liu [République populaire de Chine] ; Lijuan Wang [République populaire de Chine] ; Li Zhang [République populaire de Chine] ; Jianjun Hu [République populaire de Chine] ; Jun Chen [République populaire de Chine] ; Huanquan Zheng [Canada] ; Mengzhu Lu [République populaire de Chine] | Characterization of the Populus Rab family genes and the function of PtRabE1b in salt tolerance. |
| 001021 (2018) |
Haoran Wang [République populaire de Chine] ; Mingxiu Wang [République populaire de Chine] ; Qiang Cheng [République populaire de Chine] | Capturing the Alternative Cleavage and Polyadenylation Sites of 14 NAC Genes in Populus Using a Combination of 3'-RACE and High-Throughput Sequencing. |
| 001042 (2018) |
Wellington Muchero [États-Unis] ; Kelsey L. Sondreli [États-Unis] ; Jin-Gui Chen [États-Unis] ; Breeanna R. Urbanowicz [États-Unis] ; Jin Zhang [États-Unis] ; Vasanth Singan [États-Unis] ; Yongil Yang [États-Unis] ; Robert S. Brueggeman [États-Unis] ; Juan Franco-Coronado [États-Unis] ; Nivi Abraham [États-Unis] ; Jeong-Yeh Yang [États-Unis] ; Kelley W. Moremen [États-Unis] ; Alexandra J. Weisberg [États-Unis] ; Jeff H. Chang [États-Unis] ; Erika Lindquist [États-Unis] ; Kerrie Barry [États-Unis] ; Priya Ranjan [États-Unis] ; Sara Jawdy [États-Unis] ; Jeremy Schmutz [États-Unis] ; Gerald A. Tuskan [États-Unis] ; Jared M. Leboldus [États-Unis] | Association mapping, transcriptomics, and transient expression identify candidate genes mediating plant-pathogen interactions in a tree. |
| 001102 (2017) |
Ts A. Padvitski ; D V Galinousky ; N V Anisimova ; G Ya Baer ; Ya V. Pirko ; A I Yemets ; L V Khotyleva ; Ya B. Blume ; A V Kilchevsky | |
| 001143 (2017) |
Matthew Zinkgraf [États-Unis] ; Suzanne Gerttula [États-Unis] ; Andrew Groover [États-Unis] | Transcript profiling of a novel plant meristem, the monocot cambium. |
| 001148 (2017) |
Rui Shi [États-Unis] ; Jack P. Wang [États-Unis, République populaire de Chine] ; Ying-Chung Lin [États-Unis, République populaire de Chine, Taïwan] ; Quanzi Li [République populaire de Chine] ; Ying-Hsuan Sun [Taïwan] ; Hao Chen [États-Unis] ; Ronald R. Sederoff [États-Unis] ; Vincent L. Chiang [États-Unis, République populaire de Chine] | Tissue and cell-type co-expression networks of transcription factors and wood component genes in Populus trichocarpa. |
| 001218 (2017) |
Ying-Chung Jimmy Lin [République populaire de Chine, Taïwan, États-Unis] ; Hao Chen [États-Unis] ; Quanzi Li [République populaire de Chine] ; Wei Li [République populaire de Chine, États-Unis] ; Jack P. Wang [République populaire de Chine, États-Unis] ; Rui Shi [États-Unis] ; Sermsawat Tunlaya-Anukit [États-Unis] ; Peng Shuai [États-Unis, République populaire de Chine] ; Zhifeng Wang [République populaire de Chine] ; Hongyan Ma [République populaire de Chine] ; Huiyu Li [République populaire de Chine, États-Unis] ; Ying-Hsuan Sun [Taïwan] ; Ronald R. Sederoff [États-Unis] ; Vincent L. Chiang [États-Unis] | Reciprocal cross-regulation of VND and SND multigene TF families for wood formation in Populus trichocarpa. |
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Lise Pomiès [France] ; Mélanie Decourteix [France] ; Jérôme Franchel [France] ; Bruno Moulia [France] ; Nathalie Leblanc-Fournier [France] | Poplar stem transcriptome is massively remodelled in response to single or repeated mechanical stimuli. |
| 001272 (2017) |
Zhi Zou [République populaire de Chine] ; Guishui Xie [République populaire de Chine] ; Lifu Yang [République populaire de Chine] | Papain-like cysteine protease encoding genes in rubber (Hevea brasiliensis): comparative genomics, phylogenetic, and transcriptional profiling analysis. |
| 001352 (2017) |
Daling Zhou [République populaire de Chine] ; Qingzhang Du [République populaire de Chine] ; Jinhui Chen [République populaire de Chine] ; Qingshi Wang [République populaire de Chine] ; Deqiang Zhang [République populaire de Chine] | Identification and allelic dissection uncover roles of lncRNAs in secondary growth of Populus tomentosa. |
| 001364 (2017) |
Ertugrul Filiz [Turquie] ; Recep Vatansever [Turquie] ; Ibrahim Ilker Ozyigit [Turquie] ; Mehmet Emin Uras [Turquie] ; Ugur Sen [Turquie] ; Naser A. Anjum [Portugal] ; Eduarda Pereira [Portugal] | Genome-wide identification and expression profiling of EIL gene family in woody plant representative poplar (Populus trichocarpa). |
| 001369 (2017) |
Zhi-Chao Sun [République populaire de Chine] ; Liang-Sheng Zhang [République populaire de Chine] ; Zheng-Jia Wang [République populaire de Chine] | Genome-wide analysis of miRNAs in Carya cathayensis. |
| 001392 (2017) |
Fengxia Tian [République populaire de Chine] ; Ermei Chang [République populaire de Chine] ; Yu Li [République populaire de Chine] ; Pei Sun [République populaire de Chine] ; Jianjun Hu [République populaire de Chine] ; Jin Zhang [Oman] | Expression and integrated network analyses revealed functional divergence of NHX-type Na+/H+ exchanger genes in poplar. |
| 001424 (2017) |
Pian Rao [République populaire de Chine] ; Zhong Chen [République populaire de Chine] ; Xiaoyu Yang [République populaire de Chine] ; Kai Gao [République populaire de Chine] ; Xiong Yang [République populaire de Chine] ; Tianyun Zhao [République populaire de Chine] ; Siyan Li [République populaire de Chine] ; Bo Wu [République populaire de Chine] ; Xinmin An [République populaire de Chine, États-Unis] | Dynamic transcriptomic analysis of the early response of female flowers of Populus alba × P. glandulosa to pollination. |
| 001425 (2017) |
Zhong Chen [République populaire de Chine] ; Lexiang Ji [République populaire de Chine, États-Unis] ; Jia Wang [République populaire de Chine] ; Jinpu Jin [République populaire de Chine] ; Xiaoyu Yang [République populaire de Chine] ; Pian Rao [République populaire de Chine] ; Kai Gao [République populaire de Chine] ; Weihua Liao [République populaire de Chine] ; Meixia Ye [République populaire de Chine] ; Xinmin An [République populaire de Chine] | Dynamic changes in the transcriptome of Populus hopeiensis in response to abscisic acid. |
| 001497 (2017) |
Sara E. Blumer-Schuette [États-Unis] ; Jeffrey V. Zurawski [États-Unis] ; Jonathan M. Conway [États-Unis] ; Piyum Khatibi [États-Unis] ; Derrick L. Lewis [États-Unis] ; Quanzi Li [États-Unis] ; Vincent L. Chiang [États-Unis] ; Robert M. Kelly [États-Unis] | Caldicellulosiruptor saccharolyticus transcriptomes reveal consequences of chemical pretreatment and genetic modification of lignocellulose. |
| 001518 (2017) |
David Sundell [Suède] ; Nathaniel R. Street [Suède] ; Manoj Kumar [Suède] ; Ewa J. Mellerowicz [Suède] ; Melis Kucukoglu [Suède] ; Christoffer Johnsson [Suède] ; Vikash Kumar [Suède] ; Chanaka Mannapperuma [Suède] ; Nicolas Delhomme [Suède] ; Ove Nilsson [Suède] ; Hannele Tuominen [Suède] ; Edouard Pesquet [Suède] ; Urs Fischer [Suède] ; Totte Niittyl [Suède] ; Björn Sundberg [Suède] ; Torgeir R. Hvidsten [Suède, Norvège] | AspWood: High-Spatial-Resolution Transcriptome Profiles Reveal Uncharacterized Modularity of Wood Formation in Populus tremula. |
| 001525 (2017) |
Yuehong Chen [République populaire de Chine] ; Qinghua Cao [République populaire de Chine] ; Xiang Tao [République populaire de Chine] ; Huanhuan Shao [République populaire de Chine] ; Kun Zhang [République populaire de Chine] ; Yizheng Zhang [République populaire de Chine] ; Xuemei Tan [République populaire de Chine] | Analysis of de novo sequencing and transcriptome assembly and lignocellulolytic enzymes gene expression of Coriolopsis gallica HTC. |
| 001619 (2016) |
Igor A. Yakovlev [Norvège] ; Elena Carneros [Norvège] ; Yeonkyeong Lee [Norvège] ; Jorunn E. Olsen [Norvège] ; Carl Gunnar Fossdal [Norvège] | Transcriptional profiling of epigenetic regulators in somatic embryos during temperature induced formation of an epigenetic memory in Norway spruce. |
| 001647 (2016) |
Cuauhtemoc Licona-Cassani [Mexique] ; Jennifer A. Steen [Australie] ; Nicolas E. Zaragoza [Australie] ; Glenn Moonen [Australie] ; George Moutafis [Australie] ; Mark P. Hodson [Australie] ; John Power [Australie] ; Lars K. Nielsen [Australie] ; Esteban Marcellin [Australie] | Tetanus toxin production is triggered by the transition from amino acid consumption to peptides. |
